海關(guān)編號指申報單位或預(yù)錄入單位對該單位填制錄入的報關(guān)單的編號，用于該單位與海關(guān)之間引用其申報后尚未批準放行的報關(guān)單。報關(guān)單錄入憑單的編號規(guī)則由申報單位自行決定。預(yù)錄入報關(guān)單及EDI報關(guān)單的預(yù)錄入編號由接受申報的海關(guān)決定編號規(guī)則，計算機自動打印。指海關(guān)接受申報時給予報關(guān)單的編號。海關(guān)編號由各海關(guān)在接受申報環(huán)節(jié)確定，應(yīng)標識在報關(guān)單的每一聯(lián)上。

  報關(guān)單海關(guān)編號為9位數(shù)碼，其中前兩位為分關(guān)(辦事處)編號，第三位由各關(guān)自定義，后六位為順序編號。各直屬海關(guān)對香港貨代公司進口報關(guān)單和香港貨代公司出口報關(guān)單應(yīng)分別編號，并確保在同一公歷年度內(nèi)，能按進口和出口唯一地標識本關(guān)區(qū)的每一份報關(guān)單。進口口岸/出口口岸。指貨物實際進(出)我國關(guān)境口岸海關(guān)的名稱。本欄目應(yīng)根據(jù)貨物實際香港貨代公司進(出)口的口岸海關(guān)選擇填報《關(guān)區(qū)代碼表》中相應(yīng)的口岸海關(guān)名稱及代碼。
  加工貿(mào)易合同項下貨物必須在海關(guān)核發(fā)的《登記手冊》(或分冊，下同)限定或指定的口岸與貨物實際進出境口岸不符的，應(yīng)向合同備案主管海關(guān)辦理《登記手冊》的變更手續(xù)后填報。
  進口轉(zhuǎn)關(guān)運輸貨物應(yīng)填報貨物進境地海關(guān)名稱及代碼，出口轉(zhuǎn)關(guān)運輸貨物應(yīng)填報貨物出境地海關(guān)名稱及代碼。按轉(zhuǎn)關(guān)運輸方式監(jiān)管的跨關(guān)區(qū)深加工結(jié)轉(zhuǎn)貨物，出口報關(guān)單填報轉(zhuǎn)出地海關(guān)名稱及代碼，進口報關(guān)單填報轉(zhuǎn)入地海關(guān)名稱及代碼。其他未實際進出境的貨物，填報接受申報的海關(guān)名稱及代碼。